23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2340 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  100 
 
 		 162 aa  334  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  95.68 
 
 		 162 aa  326  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  59.38 
 
 		 165 aa  202  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  59.38 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  56.88 
 
 		 163 aa  191  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  51.25 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  48.73 
 
 		 207 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  40.25 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  39.87 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  40.88 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  39.24 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  38.99 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  35.85 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  28.48 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  25.83 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.48 
 
 		 359 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  23.78 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  32.89 
 
 		 159 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  22.64 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  43.14 
 
 		 1008 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  43.14 
 
 		 1011 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  43.14 
 
 		 1011 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  28.7 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>