37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3293 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  79.33 
 
 		 163 aa  251  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  53.69 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  35.17 
 
 		 185 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  30.46 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  36.36 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  29.85 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  29.1 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  30.5 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  28.37 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  24.82 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  26.95 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  26.21 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  31.08 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  27.89 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  28.57 
 
 		 325 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  28.86 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  28.57 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  26.35 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  28.76 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  26.35 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  27.14 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  26.35 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  23.84 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  42 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  29.25 
 
 		 323 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  25.17 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  28.86 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  23.61 
 
 		 168 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  25.68 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  29.66 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  27.7 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  30.41 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  22.86 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  27.42 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>