13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1058 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  100 
 
 		 163 aa  330  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  55.28 
 
 		 165 aa  198  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  58.39 
 
 		 164 aa  197  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  57.06 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  51.25 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  48.75 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  47.8 
 
 		 207 aa  153  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  38.99 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  38.36 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  37.74 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  37.74 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  35.85 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  35.85 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>