44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0458 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  100 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0874  Rubrerythrin  38.99 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000319278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  32.89 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  28.76 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  26.17 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  40.35 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  31.82 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  27.04 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  25.49 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  26.14 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  27.89 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3113  hypothetical protein  26.98 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  25.83 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2896  hypothetical protein  26.98 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  25.83 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  28.76 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  30.61 
 
 		 323 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3137  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.430052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2865  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  26.09 
 
 		 323 aa  44.7  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3116  hypothetical protein  26.19 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  26.53 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  28.37 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  25.17 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  26.88 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  28 
 
 		 363 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  26.14 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3134  hypothetical protein  26.19 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  37.25 
 
 		 151 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  30.14 
 
 		 323 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3103  YhjR  25.4 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  28.95 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2891  hypothetical protein  26.19 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496487  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  24.84 
 
 		 318 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  33.96 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.28 
 
 		 323 aa  41.2  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  24.06 
 
 		 325 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  24.06 
 
 		 325 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  23.74 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  24.82 
 
 		 330 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2134  YhjR  25.4 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.07 
 
 		 322 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  29.05 
 
 		 323 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  24 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>