27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0104 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  100 
 
 		 139 aa  287  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  34.35 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  28.24 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  24.22 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  26.76 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  26.87 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  28.79 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  29.25 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  26.56 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  29.93 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  32.58 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  27.78 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  25.35 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  23.91 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  40.91 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  28.47 
 
 		 157 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  27.86 
 
 		 165 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  27.54 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  26.24 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  47.37 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  38.64 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2925  hypothetical protein  35.85 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  35.09 
 
 		 327 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  47.37 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1300  hypothetical protein  35.85 
 
 		 189 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000609616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  28.47 
 
 		 165 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>