31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1807 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  100 
 
 
151 aa  302  9.000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  54.97 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  53.64 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  50.99 
 
 
149 aa  154  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  49.67 
 
 
150 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  46.36 
 
 
151 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  37.09 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  32.09 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  28.29 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  32.19 
 
 
161 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  26.95 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  33.09 
 
 
167 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  26.67 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  30.92 
 
 
161 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  30.08 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  28.28 
 
 
327 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  47  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  28.28 
 
 
327 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.26 
 
 
1008 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.47 
 
 
1011 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.47 
 
 
1011 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  27.59 
 
 
327 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  32.58 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  26.76 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  29.63 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  28.57 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  26.52 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.57 
 
 
1005 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  25.85 
 
 
284 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  28.97 
 
 
318 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  30 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>