27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1189 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  100 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  97.24 
 
 		 145 aa  280  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  37.16 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  37.16 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  38.89 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  37.84 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  38.3 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  38.3 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  37.75 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  33.33 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  39.86 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  35.57 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  30.14 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  32.69 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  30.67 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  26.32 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  32.68 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  28.95 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  26.32 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  28.76 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  28.1 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  32.33 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  27.78 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  26.45 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  26 
 
 		 161 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  27.27 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>