29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1783 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  45.7 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  49.67 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  49.67 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  47.02 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  46.36 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  41.06 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  32.88 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  30.46 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  30.22 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  24.63 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  30.14 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  30 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  30.07 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  27.78 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  24.43 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  26.53 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  27.7 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  30 
 
 		 161 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  26.28 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  26.28 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  24.68 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  41.46 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  39.02 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  29.33 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  37.5 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  29.37 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  26.49 
 
 		 325 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>