25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1052 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  100 
 
 		 150 aa  303  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  52.35 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  53.69 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  37.16 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  24.63 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  27.21 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  28.29 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  23.53 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  37.97 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  26.17 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  28.1 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  24.03 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  23.94 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  26.87 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  24.48 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  24.82 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  21.13 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  28.67 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  29.14 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  24.11 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  25.9 
 
 		 325 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  28.86 
 
 		 323 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  25.87 
 
 		 151 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  26.32 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  26.32 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>