36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2151 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  37.91 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  39.1 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  34.93 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  31.21 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  30.97 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  32.92 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  32.3 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  34.62 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  33.11 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  37.75 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  30.97 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  37.09 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  30.52 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  33.1 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  34 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  30.34 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  30.34 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  31.21 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  28.39 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  30.34 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  32.67 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  37.97 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  30.41 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  26.85 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  42 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1548  hypothetical protein  40.74 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  26.9 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  42 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  37.25 
 
 		 165 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  26.14 
 
 		 151 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 602 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  29.22 
 
 		 165 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  41.18 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  41.18 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>