28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0235 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  31.87 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  30.67 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  30 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  31.37 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  30.38 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  26.45 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  28.39 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  30.38 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  32.68 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  27.78 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  25.52 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  32.89 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  24.83 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  29.53 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  26.39 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  24.03 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  25.17 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  25.16 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  24.31 
 
 		 363 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  26.38 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  25 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  25.16 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  25 
 
 		 158 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  24.49 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  26.76 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  26.9 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>