22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1560 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  100 
 
 		 171 aa  349  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  41.22 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  41.89 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  34.27 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  33.57 
 
 		 162 aa  90.9  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  35 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  29.86 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  29.86 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  30.14 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  24.84 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  29.45 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  24.84 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  30.19 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  30 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  27.85 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  29.33 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  30.34 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  31.69 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  25.16 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  24.69 
 
 		 165 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  25.86 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>