13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3560 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  99.37 
 
 		 158 aa  321  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  71.52 
 
 		 158 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  71.52 
 
 		 158 aa  240  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  68.99 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  60.53 
 
 		 157 aa  201  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  50.34 
 
 		 226 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  27.04 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  26.35 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  30.07 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  25 
 
 		 157 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  27.03 
 
 		 150 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  26.24 
 
 		 157 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>