17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3145 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  100 
 
 		 158 aa  320  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  82.91 
 
 		 158 aa  276  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  79.11 
 
 		 158 aa  267  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  71.52 
 
 		 158 aa  240  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  70.89 
 
 		 158 aa  239  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  62.75 
 
 		 157 aa  208  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  47.65 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  25.32 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  24.34 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  28.86 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  24.16 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  24.83 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  24.16 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  26.39 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  26.17 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  26.09 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>