27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0591 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  100 
 
 
157 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  48.75 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  48.89 
 
 
142 aa  130  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  48.15 
 
 
142 aa  128  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  38.89 
 
 
145 aa  84  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  38.89 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  37.67 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  35.37 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  37.24 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  33.33 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  33.1 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  28.85 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  28.85 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  28.48 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  30.19 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  28.95 
 
 
163 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  32.67 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  30.14 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  33.56 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  28.1 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  27.03 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  29.53 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  26.24 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  26.24 
 
 
158 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  26.09 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  27.46 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>