14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0179 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  100 
 
 		 158 aa  324  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  79.11 
 
 		 158 aa  267  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  76.58 
 
 		 158 aa  258  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  71.52 
 
 		 158 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  71.52 
 
 		 158 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  65.13 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  51.68 
 
 		 226 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  26.45 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  31.08 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  23.49 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  29.41 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  22.82 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  23.49 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  22.38 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>