47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3220 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  32.12 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  31.93 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  33.55 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  32.24 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  34.62 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  27.1 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  27.1 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  28.95 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  33.33 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  26.28 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  33.33 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  32.7 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  30.26 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  23.84 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  23.84 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  26.45 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  28.76 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  29.25 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  29.33 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  28.57 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  33.55 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.12 
 
 		 1005 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  25.32 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  27.04 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  26.45 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  26.42 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  29.87 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  24.83 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  27.4 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  31.17 
 
 		 302 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  24.36 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  27.5 
 
 		 1008 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.32 
 
 		 994 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  27.08 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.12 
 
 		 1011 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.12 
 
 		 1011 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  25.32 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  29.05 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  28.95 
 
 		 301 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.97 
 
 		 994 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 363 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1548  hypothetical protein  27.86 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2111  hypothetical protein  25.71 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  31.15 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  25.17 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  26.71 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>