10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2254 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  52.35 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  53.02 
 
 		 157 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  50.34 
 
 		 158 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  50.34 
 
 		 158 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  51.68 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  47.65 
 
 		 158 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  28.57 
 
 		 165 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  29.08 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  26.43 
 
 		 165 aa  45.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>