17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0804 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  100 
 
 		 157 aa  322  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  68.63 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  65.13 
 
 		 158 aa  216  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  62.75 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  60.53 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  60.53 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  53.02 
 
 		 226 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  29.87 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  24.68 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  26.35 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  28.67 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  24.03 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  30.2 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  28.47 
 
 		 139 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  26.39 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  26.35 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  28.7 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>