18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0384 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  82.91 
 
 		 158 aa  276  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  76.58 
 
 		 158 aa  258  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  68.99 
 
 		 158 aa  236  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  68.99 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  68.63 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  52.35 
 
 		 226 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  24.83 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  27.66 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  26.17 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  24.36 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  29.25 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  27.7 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  26.17 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  28.86 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 363 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  23.4 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  26.9 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>