23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03930 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  100 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  38.51 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  35 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  34.29 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  36.18 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  37.24 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  35.77 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  31.06 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  31.06 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  36.18 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  33.8 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  31.21 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  28.76 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  29.61 
 
 
145 aa  53.9  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  28.95 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  31.69 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  28.86 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  27.97 
 
 
159 aa  43.9  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  30.07 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  27.97 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  30.07 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  31.94 
 
 
161 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  29.41 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>