32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0468 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  100 
 
 
161 aa  330  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  50 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  47.13 
 
 
159 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  44.44 
 
 
171 aa  147  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  46.75 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  38.75 
 
 
161 aa  124  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  39.38 
 
 
161 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  34.36 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1897  hypothetical protein  30.67 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  32.37 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  27.95 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  28.57 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2111  hypothetical protein  29.41 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2707  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000186708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1509  hypothetical protein  25.87 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.77 
 
 
1011 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.77 
 
 
1011 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.07 
 
 
1008 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  27.01 
 
 
1005 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  27.4 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  24.83 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  25.19 
 
 
994 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  37.7 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
363 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  26.76 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  24.34 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  26.88 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3137  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.430052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2865  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  29.41 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3113  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2896  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>