17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2304 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  31.13 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  33.33 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  32.37 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  29.03 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  27.5 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  26.09 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  25.47 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  28.38 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  32.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  31.34 
 
 
145 aa  47.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  25 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  26.85 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2707  hypothetical protein  23.78 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000186708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1509  hypothetical protein  23.08 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  31.94 
 
 
157 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  24.85 
 
 
161 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>