28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1311 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  100 
 
 		 159 aa  327  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  88.05 
 
 		 159 aa  290  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  47.13 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  40.51 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  42.04 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  33.12 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  31.85 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  30.57 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2707  hypothetical protein  34.27 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000186708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1509  hypothetical protein  30.28 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  30.46 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  30.46 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  30.83 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  31.43 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  27.27 
 
 		 1008 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.57 
 
 		 1011 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.57 
 
 		 1011 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2111  hypothetical protein  23.75 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.76 
 
 		 1005 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  26.4 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1897  hypothetical protein  22.15 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00778692  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  29.79 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  23.57 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  28.06 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  24.83 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  26.87 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  28.57 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>