24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0583 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  29.09 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  29.5 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  25.45 
 
 
168 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  26.21 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  26.21 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  24.83 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  28.99 
 
 
323 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  25 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  29.08 
 
 
345 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  24.32 
 
 
363 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  28.67 
 
 
164 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  28.26 
 
 
323 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  24.48 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  26.4 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  28 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  28.78 
 
 
323 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  24.6 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  29.71 
 
 
323 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  24.16 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  27.74 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  23.74 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  25.55 
 
 
279 aa  40.8  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  23.4 
 
 
158 aa  40.8  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>