32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2914 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  100 
 
 		 159 aa  329  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  88.05 
 
 		 159 aa  290  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  46.75 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  40.65 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  39.61 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  33.54 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  32.47 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  31.17 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  31.13 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  30 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2707  hypothetical protein  31.47 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000186708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  29.33 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  30.3 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1509  hypothetical protein  28.67 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.79 
 
 		 1008 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.03 
 
 		 1011 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.03 
 
 		 1011 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  30.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  28.78 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.24 
 
 		 1005 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2111  hypothetical protein  23.12 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  28 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1897  hypothetical protein  21.94 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00778692  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  27.14 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  27.4 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  28.06 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  27.34 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  27.14 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  25.86 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  26.67 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  23.94 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  27.27 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>