13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1897 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1897  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  323  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00778692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  41.21 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  40.88 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  42.86 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  42.24 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  35.22 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  30.67 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  29.27 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  22.15 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  21.94 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>