9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1509 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2707  hypothetical protein  89.68 
 
 		 155 aa  275  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000186708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  27.78 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  25.87 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  30.28 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  29.33 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  29.66 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  28.67 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  23.08 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>