9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2707 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2707  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  310  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000186708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1509  hypothetical protein  89.68 
 
 
155 aa  275  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  29.17 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  34.27 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  27.27 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  31.47 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  28.19 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  30.34 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  23.78 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>