32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1536 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  42.38 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  43.71 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  39.07 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  41.06 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  39.74 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  37.09 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  34.07 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  35.66 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  30.3 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  30.83 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  28.28 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  24.22 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  27.1 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.6 
 
 		 1005 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  23.94 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  31.36 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  26.35 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  28.86 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  37.7 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  25.45 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  23.53 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  29.13 
 
 		 1011 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  29.13 
 
 		 1011 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  25.45 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  26.14 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  29.13 
 
 		 1008 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  27.33 
 
 		 161 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  23.23 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  23.87 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>