14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0797 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  82.12 
 
 		 151 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  80.79 
 
 		 151 aa  247  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  27.46 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  29.41 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  28.37 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  28.03 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  25.53 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  25.36 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  24.11 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  26.39 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  27.45 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  30 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  23.23 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>