12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_784 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  100 
 
 		 151 aa  300  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  83.44 
 
 		 151 aa  261  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  82.12 
 
 		 173 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  26.76 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  30.38 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  29.41 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  30.2 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  27.89 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  28.57 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  23.87 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  29.13 
 
 		 226 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>