29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2114 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  62.25 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  54.97 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  53.64 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  45.7 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  47.02 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  39.07 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  31.85 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  30.6 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  29.1 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  30.32 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  27.21 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  28.24 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  30.38 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  26.35 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  25.68 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  28.03 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  26 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  26.17 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1085  hypothetical protein  28.03 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  24.18 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  31.29 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  26.14 
 
 		 154 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  37.25 
 
 		 170 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  26.35 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  37.5 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  36.54 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  36.54 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2186  hypothetical protein  27.87 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>