32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2310 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  100 
 
 		 162 aa  328  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  99.36 
 
 		 159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  54.78 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  46.91 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  45.86 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  47.77 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  33.57 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  30.97 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  27.1 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  29.41 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  31.33 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  30.07 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  30.67 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  30 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  29.41 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  34.72 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  34.03 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  28.85 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  30.07 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  28.39 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  28.1 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.11 
 
 		 1005 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  38.46 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  27.12 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  27.97 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  25.45 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.11 
 
 		 1011 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.11 
 
 		 1011 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  39.34 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  31.94 
 
 		 167 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  36.54 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>