30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0191 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  99.36 
 
 		 162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  55.06 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  48.41 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  46.2 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  47.5 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  34.27 
 
 		 171 aa  94  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  31.21 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  27.1 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  29.68 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  30.32 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  31.33 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  30.67 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  30.67 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  29.49 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  34.72 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  28.85 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  34.03 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  30.07 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  28.39 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  28.76 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  27.33 
 
 		 1005 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  26.21 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  38.46 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  27.97 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  25.45 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  39.34 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  31.94 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  36.54 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>