26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0914 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  100 
 
 
142 aa  279  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  98.59 
 
 
142 aa  276  9e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  52.82 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  48.15 
 
 
157 aa  128  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  38.78 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  38.3 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  37.59 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  34.29 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  33.12 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  33.12 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  32.67 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  36.11 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  32.43 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  30.34 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  34.03 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  34.03 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  29.25 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  26.17 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  28 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  27.03 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  28.15 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.37 
 
 
1011 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.37 
 
 
1011 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  27.66 
 
 
1008 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  38.64 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>