22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0832 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  329  8e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  90.57 
 
 		 162 aa  291  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  50.96 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  50.32 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  48.41 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  46.91 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  37.91 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  31.93 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  29.87 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  27.74 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  27.1 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  29.86 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  32.67 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  32.67 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  25.17 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  25.17 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  28.95 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  26.32 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  25 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  27.21 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.67 
 
 		 1011 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  28.67 
 
 		 1011 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>