25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0852 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  100 
 
 		 156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  99.36 
 
 		 156 aa  303  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  37.16 
 
 		 145 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  36.49 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  33.76 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  32.3 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  31.33 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  31.33 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  33.77 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  33.12 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  35.37 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  31.29 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  27.27 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  27.27 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  31.06 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  23.84 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  24.84 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  25.17 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  24.49 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  25.83 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  23.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  33.08 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  25.52 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6407  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.86 
 
 		 353 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1548  hypothetical protein  22.45 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>