30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1557 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  100 
 
 
161 aa  319  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  88.82 
 
 
161 aa  285  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  41.89 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  33.55 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  29.49 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  29.68 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  29.41 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  27.74 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  30.97 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  30.52 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  27.27 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  27.27 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  36.18 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  29.53 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  27.27 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  30.13 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  30.38 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  28.67 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  33.56 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  28 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  26.9 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  31.03 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  28.86 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  26.8 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  24.49 
 
 
277 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  26.21 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  26.45 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  29.31 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  26.45 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  27.56 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>