26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1266 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  100 
 
 		 145 aa  288  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  97.24 
 
 		 145 aa  280  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  36.49 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  36.49 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  38.89 
 
 		 157 aa  83.6  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  37.16 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  37.59 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  37.59 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  37.09 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  39.19 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  32.7 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  34.9 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  29.45 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  31.41 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  30.32 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  30.07 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  32.89 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  30.07 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  29.61 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  26.8 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  31.34 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  26.9 
 
 		 271 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  25.35 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  26.45 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  26.67 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>