24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0328 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  322  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  90.57 
 
 		 163 aa  291  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  49.69 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  49.69 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  47.5 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  47.77 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  39.1 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  32.12 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  29.49 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  30.52 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  28.21 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  29.86 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  32.43 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  32.43 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  25.83 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  28.48 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  25.83 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  27.78 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  26.8 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  26.32 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  28.86 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  23.87 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.07 
 
 		 1011 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.07 
 
 		 1011 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>