29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3533 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  100 
 
 
161 aa  320  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  88.82 
 
 
161 aa  285  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  41.22 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  32.24 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  30.32 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  30.07 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  28.21 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  36.18 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  27.1 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  27.27 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  27.27 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  30.52 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  28.57 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  29.68 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  26.32 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  29.53 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  32.67 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  30.38 
 
 
157 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  27.7 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  27.03 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  28.76 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  26.53 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  30.51 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  26.6 
 
 
327 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  26.67 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  26.6 
 
 
327 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  26 
 
 
145 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  40.38 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  27.52 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>