15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0888 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  100 
 
 		 165 aa  331  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  40.24 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  42.5 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1223  hypothetical protein  37.04 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.389238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  30.32 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  29.09 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  25.19 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  26.42 
 
 		 277 aa  44.3  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  27.14 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  31.08 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  29.14 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  37.31 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  28.95 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  24.83 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  30.41 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>