38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3902 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  100 
 
 		 323 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  95.05 
 
 		 345 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  94.12 
 
 		 323 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  86.38 
 
 		 323 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  79.88 
 
 		 323 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  68.11 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  63.55 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  64.09 
 
 		 323 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  59.44 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  57.28 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  57.37 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  59.32 
 
 		 330 aa  371  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  59.13 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  55.42 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  58.39 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  59.06 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  55.73 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  58.39 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  63.78 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  55.94 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  58.7 
 
 		 327 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  57.01 
 
 		 327 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  56.39 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  56.35 
 
 		 319 aa  344  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  57.59 
 
 		 325 aa  341  8e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  57.59 
 
 		 325 aa  341  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  63.37 
 
 		 322 aa  335  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  58.07 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  68.9 
 
 		 178 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  60.13 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  58.44 
 
 		 172 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.09 
 
 		 175 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  57.69 
 
 		 174 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.35 
 
 		 163 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  32.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.83 
 
 		 289 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.95 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  28.26 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>