40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7128 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  82.35 
 
 		 323 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  80.19 
 
 		 345 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  79.88 
 
 		 323 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  80.19 
 
 		 323 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  65.94 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  65.94 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  60.62 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  58.7 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  58.82 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  58.75 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  56.52 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  59.32 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  59.5 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  56.52 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  59.32 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  57.59 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  60.62 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  60 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  57.76 
 
 		 330 aa  371  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  63.47 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  58.39 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  54.97 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  58.7 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  57.59 
 
 		 325 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  57.59 
 
 		 325 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  55.73 
 
 		 319 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  62.05 
 
 		 322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  71.17 
 
 		 178 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  58.1 
 
 		 267 aa  199  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  52.07 
 
 		 172 aa  162  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.33 
 
 		 175 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  54.49 
 
 		 174 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.49 
 
 		 163 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.09 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  31.06 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  30.41 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  30.92 
 
 		 150 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  29.09 
 
 		 175 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  29.71 
 
 		 161 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>