38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4102 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  100 
 
 		 323 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  87.31 
 
 		 345 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  86.38 
 
 		 323 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  86.38 
 
 		 323 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  82.35 
 
 		 323 aa  537  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  68.73 
 
 		 323 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  65.33 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  61.8 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  60.99 
 
 		 318 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  60.44 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  57.45 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  55.59 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  55.59 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  58.2 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  64.09 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  59.5 
 
 		 327 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  58.39 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  58.39 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  58.39 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  58.26 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  57.19 
 
 		 323 aa  362  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  58.07 
 
 		 327 aa  355  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  54.66 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  56.35 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  57.76 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  61.39 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  55.38 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  55.38 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  68.1 
 
 		 178 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  58.54 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  59.74 
 
 		 172 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.97 
 
 		 175 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  57.5 
 
 		 174 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.25 
 
 		 163 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  31.37 
 
 		 175 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.76 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  28.78 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>