36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0107 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  100 
 
 		 323 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  69.25 
 
 		 330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  69.57 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  69.25 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  68.55 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  68.55 
 
 		 327 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  69.59 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  66.77 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  66.98 
 
 		 327 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  73.48 
 
 		 325 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  73.48 
 
 		 325 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  68.34 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  68.34 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  63.21 
 
 		 325 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  59.5 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  58.15 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  60.31 
 
 		 323 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  59.06 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  59.06 
 
 		 323 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  64.78 
 
 		 327 aa  353  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  56.65 
 
 		 318 aa  352  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  59.18 
 
 		 318 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  57.19 
 
 		 323 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  59.81 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  56.01 
 
 		 319 aa  325  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.62 
 
 		 323 aa  318  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  56.56 
 
 		 323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.14 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  59.05 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  66.86 
 
 		 178 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  56.1 
 
 		 172 aa  165  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.49 
 
 		 175 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  59.48 
 
 		 174 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.64 
 
 		 163 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  31.88 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  26.09 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>