38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1505 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  99.7 
 
 		 330 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  100 
 
 		 330 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  94.85 
 
 		 330 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  68.55 
 
 		 327 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  68.1 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  68.55 
 
 		 327 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  69.57 
 
 		 323 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  73.95 
 
 		 325 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  69.4 
 
 		 327 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  73.95 
 
 		 325 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  66.25 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  68.77 
 
 		 327 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  69.28 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  64.58 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  67.79 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  57.41 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  59.32 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  56.53 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  59.94 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  58.39 
 
 		 323 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  58.39 
 
 		 323 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  59.01 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  54.26 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.14 
 
 		 323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  54.57 
 
 		 319 aa  318  9e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  54.04 
 
 		 323 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  55.84 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.42 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  71.7 
 
 		 267 aa  242  6e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  62.13 
 
 		 178 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.76 
 
 		 175 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  55.7 
 
 		 172 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  53.85 
 
 		 174 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.96 
 
 		 163 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  30 
 
 		 175 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  27.68 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  30.06 
 
 		 174 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  30.06 
 
 		 174 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>