35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2075 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  94.86 
 
 
174 aa  327  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  94.86 
 
 
174 aa  325  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  69.94 
 
 
175 aa  244  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  32.26 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  31.9 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  30.06 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  28.93 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  29.08 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  32.17 
 
 
323 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  26.28 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  30 
 
 
330 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  23.29 
 
 
302 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  30 
 
 
330 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  27.35 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  28 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  30 
 
 
330 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  28.78 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  27.69 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  26.03 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  28.37 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.33 
 
 
323 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  28 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  24.29 
 
 
155 aa  44.3  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  29.52 
 
 
318 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  29.7 
 
 
327 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  26.81 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  24.82 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  29.7 
 
 
327 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  23.24 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  26.03 
 
 
301 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  24.18 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  29.7 
 
 
327 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  30.13 
 
 
327 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  30.61 
 
 
325 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>