44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3443 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  100 
 
 		 323 aa  658    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  69.35 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  68.73 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  68.11 
 
 		 323 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  67.18 
 
 		 323 aa  431  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  68.11 
 
 		 323 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  65.94 
 
 		 323 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  57.19 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  53.75 
 
 		 327 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  54.04 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  54.04 
 
 		 330 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  55.73 
 
 		 318 aa  348  6e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  54.04 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  55.9 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  55.11 
 
 		 318 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  54.35 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  55.94 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  52.17 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  52.17 
 
 		 327 aa  345  7e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  56.56 
 
 		 323 aa  338  8e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  52.48 
 
 		 325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  54.35 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  56.35 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  53.8 
 
 		 325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  53.8 
 
 		 325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  50.15 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.76 
 
 		 322 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  52.17 
 
 		 327 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  69.14 
 
 		 178 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  63.29 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  54.88 
 
 		 172 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  54.65 
 
 		 174 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.88 
 
 		 175 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.23 
 
 		 163 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  31.72 
 
 		 175 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  29.41 
 
 		 175 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  32.19 
 
 		 170 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  29.45 
 
 		 174 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  29.45 
 
 		 174 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.81 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.94 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  28.86 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  27.86 
 
 		 161 aa  42.7  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  28.16 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>